Флаг Аяно-Майского района утвержден Решением Собрания депутатов Аяно-Майского МР от 20 апреля 2010 года № 76 "О флаге Аяно-Майского муниципального района Хабаровского края".

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух горизонтальных полос зеленой и голубой в отношении 2:1, по линии разделения которых выложены белые квадраты; в середине полотнища белыми цветами изображены фигуры из герба района: на зеленом полосе - голова оленя и между его рогов соболя, на голубой полосе - краба".

Символика цветов и фигур флага сходна с символикой герба:

"... Аяно-Майский район - один из самых отдаленных, северных районов Хабаровского края. Земли района с юго-востока омываются водами Охотского моря (в гербе символически отражено лазурью). Среди растительности района выделяются аянская голубая ель, сосна, брайя стручковая (единственное место произрастания в России). Вся флора района отражена на гербе зеленым цветом. Кайма, составленная из малых ромбов - "оленья тропа" - аллегория эвенкийских национальных узоров, символически отражает национальные особенности района.
Голова оленя символизирует основное занятие местных жителей - оленеводство. Олень для эвенков главный помощник в кочевой жизни, это и мясо, и одежда, и обувь и лекарство.
Соболь (особая гордость жителей района - местный баргузинский кряж) представляет богатую фауну Хабаровского края и пушной промысел, издревле ведущийся в необъятных просторах тайги.
Краб - символ морской фауны, успешного рыболовства и добычи морепродуктов. Зеленый цвет символизирует весну, здоровье, природу, надежду. Лазурь - символ возвышенных устремлений, мышления, искренности и добродетели. Серебро в геральдике - символ чистоты, совершенства, божественной мудрости, благородства, мира".

Использованы материалы брошюры "Символика Российской Федерации, Хабаровского края, муниципальных образований края" Методика. Информация. Практика. №2 (73) 2010 г. (предоставлена Б.Вольфовым)

Флаг Аяно-Майского района внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №6370.