Наро-Фоминский район Московской области был образован 12 июля 1929 года. С началом муниципальной реформы на территории района создано муниципальное образование "Наро-Фоминский район". В 2005 году в составе Наро-Фоминского муниципального района созданы муниципальные образования 1-го уровня: городские поселения Апрелевка, Верея, Калининец, Наро-Фоминск, Селятино, Киевский (в 2012 году передано в состав Москвы), Кокошкино (в 2012 году передано в состав Москвы), сельские поселения Атепцевское, Веселёвское, Волчёнковское, Ташировское, Марушкинское (в 2012 году передано в состав Москвы), Новофёдоровское (в 2012 году передано в состав Москвы), Первомайское (в 2012 году передано в состав Москвы).

Флаг муниципального образования "Наро-Фоминский район"Московской области" утвержден Решением Совета депутатов Наро-Фоминского района от 21 февраля 2003 года № 5/33. Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 1154. Описание флага:

3.1. Описание флага муниципального образования - Наро-Фоминский район:
Флаг муниципального образования Наро-Фоминский район представляет собой полотнище с соотношением сторон 2:3 разделено волнистыми линиями на три неравных части: красную (у древка), белую полосу, вверху упирающуюся осью в 2/3 верхнего края полотнища от древка, внизу - нижним краем в угол полотнища, и широкую зелёную. Зелёная часть несёт изображение расположенных по диагонали фигур из герба Нарофоминского района - белых зубчатых стен.

3.2. Обоснование символики флага муниципального образования - Наро-Фоминский район.
Зелёный цвет полотнища показывает природно-географическое расположение Наро-Фоминского района, одного из самых лесных районов Московской области.
Зеленый цвет в геральдике символизирует жизнь, изобилие, возрождение.
Геральдическая фигура - белая волнистая перевязь говорит о протекающей по всей территории района реке Наре,название которой входит в состав названия муниципального образования - Наро -Фоминский район, делая флаг «полугласным».
Белые городские зубчатые стены аллегорически показывают города Наро-Фоминск. Апрелевку и Верею, входящие в состав муниципального образования - Наро-Фоминский район».
Крепостные стены символизируют также юго-западные рубежи защиты Москвы Отечественной войны 1812 г. и Великой Отечественной войны 1941-1945 гг.. а также размещение на протяжении .многих лет на территории района Четвертой гвардейской танковой Кантемировской и Второй гвардейской мотострелковой Таманской дивизий.
Белый цвет символизирует мудрость,чистоту, веру.
Красная часть полотнища указывает на территориальную принадлежность Наро-Фоминского района к Московской области.

3.3. Авторская группа:
идея флага: Константин Моченов (г.Химки);
обоснование символики; Галина Туник(г. Москва);
компьютерный дизайн: Сергей Исаев (г.Москва).

Информация любезно предоставлена Ю.Коржиком (г.Воронеж, СГР)

Решением Совета депутатов Наро-Фоминского района от 28 сентября 2012 года № 580/42 в решение от 21.02.2003 г. внесены изменения. Но флаг не менялся.

Летом 2017 года МО "Наро-Фоминский муниципальный район" упразднено, создано новое МО "Наро-Фоминский городской округ". Все муниципальные образования в составе муниципального района упразднены. Однако, как административно-территориальная единица район сохранен, города и села в его составе сохранили свой статус.

Решением Совета депутатов Наро-Фоминского ГО от 27 марта 2018 года № 15/15 "О флаге Наро-Фоминского городского округа Московской области" бывший флаг Наро-Фоминского района был признан флагом Наро-Фоминского городского округа.

2.1. Описание флага Наро-Фоминского городского округа:
"Полотнище с соотношением сторон 2:3, разделенное волнистыми линиями на три неравных части: красную (у древка), белую полосу, вверху упирающуюся осью в 2/3 верхнего края полотнища от древка, внизу - нижним краем в угол полотнища; и широкую зелёную. Зелёная часть воспроизводит изображение расположенных по диагонали фигур из герба Наро-Фоминского городского округа - трех белых зубчатых стен".

Информация предоставлена В. Пермяковым