Район Внуково до 2012 года был эксклавом Москвы, с 2012 года (после создания Новой Москвы) район Внуково стал эксклавом Западного округа Москвы, окруженным со всех сторон территорией Новомосковского административного округа. К тому же сам район (и соответствующий ему муниципальный округ) до 2024 года состоял из двух частей

Флаг района был "гербовым", то есть повторял гербовую эмблему Внуково (утв. 5 сентября 1997 года): в голубом поле серебряный восстающий Пегас; в красной оконечности серебряный ключ в пояс бородкой вправо вверх.

Серебряный Пегас в голубом поле символизирует аэропорт "Внуково", давший название и послуживший причиной образования района. Серебряный ключ в красном поле также символизирует аэропорт "Внуково" как воздушные ворота Москвы".

Изображение флага и другие материалы любезно предоставлены И.Карташовым (г.Москва)

Флаг муниципального образования Внуково был утверждён Решением Муниципального Собрания от 8 сентября 2004 года № 47/8 "О муниципальной символике внутригородского муниципального образования Внуково в городе Москве".

Решением Муниципального собрания МО Внуково от 7 декабря 2004 года № 82/12 в решение от 8.9.2004 г. внесены изменения.

"Флаг муниципального образования Внуково представляет собой двухстороннее, прямоугольное полотнище с соотношением сторон 2:3.
Полотнище флага состоит из двух горизонтальных полос, верхней, голубой, шириной 11/16 ширины полотнища, и красной.
В центре голубой полосы помещено изображение белого летящего Пегаса. Габаритные размеры изображения составляют 5/12 длины и ? ширины полотнища.
В центре красной полосы помещено изображение белого ключа бородкой вверх, обращенного к древку. Габаритные размеры изображения составляют 1/3 длины и 1/5 ширины полотнища.

Материалы геральдического архива В.Маркова

В 2024 году район и муниципальный округ Внуково, входивший до того в Западный округ Москвы, был присоединен к Новомосковскому административному округу. При этом территория муниципального округа Внуково значительно увеличилась за счет поселения Кокошкино, части поселений Внуковское, Марушкинское, Московский.

Решением Совета депутатов ВМО МО Внуково от 10 июня 2025 года № 6/3 Совет депутатов Внуково утвердил герб и флаг района Внуково.

Описание флага муниципального округа Внуково:
"Прямоугольное синее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, на котором воспроизведена композиция фигур из герба муниципального округа с заменой геральдических серебра и золота соответственно белым и желтым цветами".

Обоснование символики (семантика) флага муниципального округа Внуково.
Флаг разработан на основе герба и повторяет его символику. Крылатый конь в синем поле символизирует аэропорт Внуково - воздушные ворота города Москвы. Решение о строительстве нового московского аэропорта, призванного стать заменой Центрального аэропорта на Ходынском поле, было принято в конце 1930-х годов.
Белая волнистая полоса на флаге указывает на реки Ликову, Сетунь и Незнайку, протекающие на территории муниципального округа.
Перо символизирует расположенный на территории муниципального округа известный всей России поселок писателей Переделкино. Здесь жили и творили известные российские литераторы, среди которых лауреат Нобелевской премии Борис Пастернак, детский писатель Корней Чуковский, поэт, бард Булат Окуджава, поэтесса Белла Ахмадулина и многие другие.
Символику флага дополняют использованные цвета, имеющие свою традиционную символику:
Белый цвет (серебро) – символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Желтый цвет (золото) – символ интеллекта, уважения, стабильности,
Синий цвет – символ чести, благородства, духовности".

Текст документа и рисунок присланы В. Марковым.