31 августа 1991 года Верховный Совет Узбекской ССР принял Закон «Об основах государственной независимости Республики Узбекистан», которым было изменено наименование Узбекская Советская Социалистическая Республика на новое - Республика Узбекистан, которая была провозглашена независимым государством (праздничным Днём независимости было объявлено 1 сентября), но её государственным флагом по-прежнему оставался Государственный флаг Узбекской ССР 1952 года. Была создана специальная комиссия Верховного Совета Республики Узбекистан, которая рассмотрела более 200 проектов нового государственного флага, поступивших от историков, депутатов и граждан. 30 сентября 1991 года на рассмотрение внеочередной седьмой сессии Верховного Совета Республики Узбекистан было вынесено три проекта, один из которых депутаты большинством голосов одобрили для утверждения в качестве нового государственного флага.

18 ноября 1991 года на восьмой сессии Верховного Совета Республики Узбекистан был принят Закон Республики Узбекистан "О Государственном флаге Республики Узбекистан" (Закон от 18 ноября 1991 года №407–XII), который сразу же, в зале заседаний, был подписан Президентом Республики Узбекистан, получил регистрационный №407-XII и вступил в силу после официального опубликования 27 ноября 1991 года в газете "Правда Востока". Законом были утверждены схематическое и цветные изображения флага и установлено его описание:

"Статья 4. Государственный флаг Республики Узбекистан представляет собой прямоугольное полотнище из трёх горизонтальных полос насыщенного голубого, белого и насыщенного зеленого цветов во всю длину флага.

Длина флага составляет 250 см, ширина – 125 см. Голубая, белая и зеленая полосы равны по ширине. Ширина каждой полосы равна 40 см. По краям белой полосы, расположенной в середине флага, проходят красные каёмки шириной в 2,5 см каждая.
На верхней голубой части флаги на лицевой и оборотной сторонах, у древка изображены белый полумесяц и рядом с ним двенадцать белых пятиконечных звезд.
Полумесяц и звезды вписываются в прямоугольник размером 75х30 см, который располагается по горизонтальной оси верхней голубой полосы.
Полумесяц располагается вертикально концами от древка и вписывается в окружность диаметром 30 см на расстоянии 20 см от древка.
Звезды вписываются в окружность диаметром 6 см. Расстояние между окружностями 6 см. Звезды располагаются по вертикали и горизонтали в следующем порядке: три звезды – в верхнем ряду, четыре – в среднем и пять – в нижнем.
Нижний ряд звезд располагается от нижнего края полумесяца на расстоянии 3,5 см".

"Правда Востока", №231 (22697), 27.11.1991, С.1

Узбекское телеграфное агентство УзТАГ распространило официальное разъяснение "О символике нового Государственного флага Республики Узбекистан», подписанное народным писателем Узбекистана Примкулом Кадыровым, академиком Академии наук Узбекистана Ахмадали Аскаровым и членом-корреспондентом АН Узбекистана Бирбаем Ахмедовым. Согласно данному разъяснению,

"1. Голубой цвет на флаге – это символ вечного неба и воды, как одного из основных источников жизни. Именно голубой цвет был цветом знамени государства Амира Тимура. По этой причине в существовавшем Государственном флаге Узбекской ССР тоже имелась голубая полоса. Таким образом, голубая полоса является символом жизненности и признаком исторической преемственности.
2. Белая полоса на флаге – это традиционный символ мира, пожелания доброго пути (ок йул), стремления к нравственной чистоте помыслов и действий.
3. Зеленый цвет – цвет природы, новой жизни и плодородия во многих государствах, где преобладающей частью населения являются мусульмане.
4. Красные линии – это жизненная сила, неиссякаемо текущая внутри каждого живого организма, связывающая наши добрые, чистые помыслы с вечным небом и реальными делами на земле.
5. Молодой полумесяц связан с историческими традициями и одновременно может рассматриваться как символ вновь рождающейся республики.
6. Звезды являются символом безоблачного неба. 12 звезд непосредственно с нашими историческими традициями, с нашим древним солнечным календарем, начинающимся с Навруза. Названия 12 месяцев этого календаря – хамал, совр, джавза, саратон, асад и другие являются одновременно названиями 12 созвездий на небе. Почитание 12 звезд связано с развитием научной мысли в государствах, существовавших на территории современного Узбекистана. По звездному каталогу Улугбека движение Солнца по небосводу в течение года точно определялось по расположению 12 древнего солнечного календаря. Восточная философия считает цифру 12 признаком всеохватности и совершенства. Это объясняется тем, что существующий мир, в котором мы живем, состоит из четырех элементов (земля, воздух, вода и огонь), которые проявляют себя в различных формах на трех уровнях: на земле, на небе и между небом и землей. 12 звезд на нашем Государственном флаге следует понимать как символическое стремление к всеохватности и совершенству. В наставлениях философа Мирсанда Барака и в трудах знаменитого историка Хондемира также говорится о 12-ти важнейших правилах, которыми должно руководствоваться при управлении страной государственным деятелям: правдивость, справедливость, терпимость к инакомыслию, нравственность, доблесть, преданность и другие непреходящие общечеловеческие качества.

"Правда Востока", №231 (22697), 27.11.1991, С.2

8 декабря 1992 года была принята Конституция Республики Узбекистан, в статье 5 которой установлено, что "Республика Узбекистан имеет свои государственные символы - флаг, герб, гимн, утверждаемые законом"

Юридическая информационная система "Право" Республики Узбекистан

Законом от 24 декабря 2010 года "О внесении изменений и дополнений в некоторые законодательные акты Республики Узбекистан о государственных символах и Кодекс Республики Узбекистан об административной ответственности" было несколько уточнено описание государственного флага Узбекистана: в статье 4 слова "полумесяц и звезды" заменены на слова "белый полумесяц и двенадцать белых пятиконечных звезд".

По сообщению А.Гутиерреза (Antonio Gutiérrez)

Существует стандарт "RST Uz 588-92 (M 51): Государственный флаг Республики Узбекистан"