Район до 2016 года именовался "Котовский", а его административный центр - "город Котовск".

Герб Подольского района утвержден Решением Подольского районного совета от 28 февраля 2023 года № 197-VIII.

Прямоугольное полотнище с соотношением ширины и длины 2:3, которое состоит из трех горизонтальных полос: зеленой, белой волнистой и красной в соотношении 2/3:1/20:1/3. На верхней зеленой полосе желтый цветок подсолнечника в виде солнца, под которым два желтых колоса накрест (шириной в 1/3 ширины флага). На нижней красной полосе желтое железнодорожное колесо с крыльями (шириной 1/5 ширины флага.

Подсолнух символизирует свет, добро, достаток, южный край. Крылатое колесо характеризует Подольск как районный центр и железнодорожный узел. Колос - эмблема плодородия и жизненной силы. Белая волнистая полоса символизирует реки и водоемы региона.

Материалы геральдического архива В. Маркова