2 мая 1918 года к власти (при содействии немецких оккупационных властей) пришло правительство гетмана П.Скоропадского.
При Скоропадском продолжал использоваться государственный флаг - сине-жёлтый. В частности в сопроводительном листе к распоряжению гетмана о военно-морском флаге от 17 июля 1918 года было сказано, что "коммерческий флаг остается без изменений: две горизонтальные полосы - верхняя - голубая (блакитная), нижняя - жёлтая.
20 мая 1918 года главный адмирал портов Чёрного моря А.Покровский и старший лейтенант Деменко обратились к товарищу морского министра контр-адмиралу М.Максимову с просьбой утвердить военно-морской “андреевский” флаг России в качестве кормового флага Украины. Максимов согласился.
Возрождение андреевского флага объяснялось тем, что апостол Андрей проповедовал именно на территории Украины, к тому же в самой России этот флаг уже официально не употреблялся (за исключением белогвардейцев). Однако, андреевский флаг для украинского флота официально так и не был утвержден.
Торговые суда несли национальный сине-жёлтый флаг. Гюйс был аналогичен национальному флагу, но имел в центре изображение трезубца на белом поле.
16 июля 1918 года гетман Скоропадский подписал приказ 192/44 (приказ объявлен 18 июля) и утвердил новый образец военно-морского флага, созданный геральдической комиссией на основе флага германского флота. Флаг был белым с синим крестом, равным по толщине 1/11 части длины полотнища, крест обрамлялся узкими белой и синей полосками (ширина обеих равнялась 1/8 толщины креста), в кантоне располагался национальный флаг, поверх которого золотой трезубец (обычно рисованный бронзой) с крестом над средним зубом.
По информации А.Басова. Фото копии рисунка флага из приложения к приказу - с сайта "Украинская революция. 100 лет борьбы" unr.memory.gov.ua
17 июля 1918 года товарищ Морского министра М.Максимов отослал Министру иностранных дел описание и рисунок этого военного флага.
Военный флаг был включен в "Морской Устав", действующий в Украинском государственном флоте в 1917-1920 годах и утвержденный окончательно 25 января 1919 года:
ст.1284. Военный флаг - белый с синим крестом, который делит флаг на четыре равные части. Ширина креста одна одиннадцатая всей длины флага. Отступив на 1/8 ширины креста, проходит около него же, такой же ширины (тоже 1/8 ширины креста) синяя полоска, кроме тех его сторон, которые прилегают к крыжу. В крыже, оступив на 1/8 ширины креста от его сторон размещается гюйс: национальный флаг государства (состоящий из синей и жёлтой горизонтальных полос), в центре которого размещается золотой трезубец с крестом, такой же ширины, как крест и 1,5 раза выше своей ширины".
В Уставе оговаривалось, что флаг носится на гафеле или кормовом флагштоке, но во время боя поднимается и на мачтах.
Флот Украины в то время значительно вырос, часть кораблей были возвращены Германией, некоторые - вновь построены. Этот флаг был признан и после смещения гетмана Директорией УНР. В частности главный атаман войск и флота УНР С.Петлюра приказал: "считать флагом Военного флота Украинской Народной Республики флаг, утвержденный 18 июля 1918 года".
По книге М.Мамчака "Военно-морская символика Украины"
Есть информация, что вместе с флагом ВМФ были утверждены должностные флаги, а также гюйс, повторяющий российский. Это символизировало былую славу Черноморского флота. Информация вызывает определенные сомнения. В Морском Уставе при описании военного флага упоминается другой гюйс - национальный флаг с трезубцем.
Должностные флаги основывались на флаге ВМФ, но имели различные дополнения:
Флаг генерала в должности командующего военно-морскими силами - два скрещенных якоря внизу у древка.
Флаг начальника морского Генерального штаба - четыре якоря в прямой крест внизу у древка.
Флаг товарища (заместителя) министра по морским делам - четыре якоря в прямой крест в центре флага.
Флаг министра по морским делам - якорь в центре флага.
В тексте использованы материалы статьи В.Трембицкого
"Флаги Украины 1918 года", "Знак" №4
Оригинальный флаг министра по морским делам был сохранен адьютантом министра по морским делам УНР капитан-лейтенантом Святославом Шрамченко, ныне этот флаг хранится в украинском национальном музее в Чикаго.
По материалам сообщения на "Википедии" (ст. Военно-морской флаг Украины)
В журнале "За Державнiсть" помимо статьи С.Шрамченко о военных флагах Украины приведены и рисунки некоторых украинских флагов, выполненные Н.Бытинским. В том числе и флаг Морского министра - военный флаг, дополненный в центре белым квадратиком с синим якорем. На рисунке Н.Бытинского синий крест военного флага имеет синюю окантовку по всем четырем сторонам. Возможно это ошибка художника, в возможно такими действительно были реально изготовленные флаги, во всяком случае на фотографии хранившегося у С.Шрамченко флага морского министра отчетливо видно, что окантовка креста также присутствует со всех четырех сторон).
По материалам сообщений на форуме УГТ Фотография флага воспроизводится по статье М.Климчак "Украинскому военно-морскому флагу - 90 лет" (Свобода, 25 апреля 2008 г)
Флаг начальника морской Генеральной квартиры - четыре якоря в косой крест внизу у древка.
Вымпелом военных кораблей Украины стало узкое белое полотнище с двумя косицами, в головке вымпела синий крест.
В сентябре 1918 года были утверждены флаги дипломатического корпуса Украины:
Флаг посла Украинской державы - национальный флаг, в середине которого белый круг (диаметром в 2/7 длины полотнища) с тонкой золотой окантовкой, в центре круга золотой трезубец Св.Владимира с крестом. Высота трезубца равна 2/11 длины флага.
Флаг посланников Украинской державы (глав дипломатических миссий) - национальный флаг, в левом верхнем углу которого на белом поле золотой трезубец Святого Владимира с крестом. Ширина белого поля - 1/3 длины флага.
В декабре 1918 года, когда флоты “Антанты" прибыли в Севастополь, командующий украинским флотом адмирал Клочовский приказал всем кораблям поднять андреевский флаг. “Антанта” передала все украинские корабли российской белой армии. Это было во многом вызвано революцией в Германии и потерей следовательно немецкой поддержки гетманом Скоропадским...
В тексте использованы материалы статьи В.Трембицкого
"Флаги Украины 1918 года", "Знак" №4
В журнале "За Державнiсть" помимо статьи С.Шрамченко о военных флагах Украины приведены и рисунки некоторых украинских флагов, выполненные Н.Бытинским. Флаг Генерального консула, Консула и Вице-консула Украинской державы - сине-жёлтое полотнище, в белом крыже синий якорь. Там же продублированы флаг Морского министра, флаг Посла Украинской державы и флаг Посланника Украинской державы.
По материалам сообщений на форуме УГТ
Вымпел военного флота Украины был белым с синим крестом у древка.