Флаг района утверждён Решением Змеиногорского районного совета депутатов от 26 октября 2012 года № 79

2.1. Флаг разработан на основе герба Змеиногорского района. Полотнище флага прямоугольной формы по диагоналям разделено на четыре части: первую лазоревую часть, вторую зелёную часть, третью зелёную часть и четвёртую чёрную часть. В центре полотнища флага находится герб района на красной круглой подложке, цвет которой подчёркивает формирование района в советское время (1924 г.).
Отношение ширины флага к его длине 2:3. Высота герба равна 1/3 ширины флага. Диаметр круга красной подложки герба равен длине диагонали герба.
2.2. Составил флаг - Чекалин В.М.
Геральдическое описание и обоснование символики — Чекалин В.М.

Для справки приведем обоснование символики герба:

2.2. Обоснование символики герба.
Красный контур щита указывает на образование района в советское время (1924 г.). Чёрная часть щита представляет недра района богатые минеральными ресурсами в виде промышленных месторождений золото-серебро-медно-свинцово-цинковых (шестиугольник) и железных (квадрат) руд, а также строительного и поделочного сырья (треугольник). Молоток и кирка символизируют геологоразведочное и горнорудное производство. Колосья пшеницы и ели, показанные в перспективе, подчёркивают бескрайние просторы соответственно хлебородных полей и покрытых лесом (тайгой) красивейших гор с живописными скалами, реками и озёрами. Район известен разнообразным туризмом на основе многочисленных интереснейших природных и исторических объектов, что олицетворяется розой ветров — восьмиконечной путеводной звездой всех странствующих. В нём находится один из крупнейших в мире оптико-лазерный центр имени Г.С.Титова (телескоп), наблюдающий за верхними слоями атмосферы,

По сообщению В. Пермякова Рисунок в заголовке по сайту http://змеиногорский-район.рф/