Рабочий посёлок Жатай образован в 1948 году. В 1998 году создано первое в Якутии муниципальное образование "посёлок Жатай", с 2004 года - "городской округ Жатай".

Флаг городского округа Жатай утвержден решением Окружного Совета депутатов от 05.09.2019 года № 73-1 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 13026. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, в центре которого круг белого цвета с тонкой каймой синего цвета и широкой внешней зубчатой каймой жёлтого цвета, на котором парусный корабль черного цвета, плывущий по тонкой волнисто выщербленной полосе синего цвета, ниже которой две таких же полосы".

Материалы геральдического архива В. Маркова. Фото свидетельства - с официального информационного портала Республики Саха (Якутия) - www.sakha.gov.ru/