Флаг Винницкого сельского поселения утвержден Решением Совета депутатов Винницкого сельского поселения №21 от 17 июня 2014 года. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 9356. Описание флага:

Флаг муниципального образования Винницкое сельское поселение Подпорожского муниципального района Ленинградской области представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к длине- 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования Винницкое сельское поселение Подпорожского муниципального района Ленинградской области в красном, белом и синем цветах.

По сообщению В.Пермякова. Рисунок предоставлен В. Марковым