Центр района - станица Казанская.

Флаг Верхнедонского района утвержден Решением Верхнедонского районного Собрания депутатов №170 от 26 ноября 2012 года. Согласно тексту Положения о флаге:

"3.1. Описание флага Верхнедонского района:
"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Верхнедонского района в синем, красном и желтом цветах".
3.2. Обоснование символики:
- столб - река Дон, делящая район на две равные части;
- золото – на протяжении веков Дон был основным кормильцем проживающих на его берегах людей; символ богатства; развитое сельское хозяйство;
- казачьи шашки – историческая связь Верхнедонского района с казачеством, ведь основали станицу Казанскую донские казаки;
- золото и лазурь – традиционные цвета выходцев из Малороссии;
- аисты, которые длительное время живут в районе, считаются символом новой жизни, приносят счастье, покровительствуют рождению детей.
3.3. Авторская группа:
- Тесля О.Р. г. Таганрог,
- Дмитриев О.В. г. Таганрог".

По информации Б.Вольфова

Флаг района (видимо, именно этот, представленный на сайте) внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №8071.