Флаг Троицкого СП утвержден решением № 111 Совета муниципального образования Троицкое сельское поселение Крымского района от 31 августа 2011 года и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 7488. Согласно тексту Положения о флаге:

Описание флага:
"Прямоугольное полотнище синего цвета с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Троицкого сельского поселения Крымского района в белом, жёлтом и чёрном цветах".

Обоснование символики герба и флага.
Герб и флаг языком символов и аллегорий отражают исторические, культурные и экономические особенности сельского поселения.
На левом берегу Кубани в 1865 году вокруг Новоохранного поста поселилось 124 семьи - 828 человек. Это и считается началом Троицкой названной в честь Троицкого пехотного полка.
На средства войскового правления и прихожан в 1886 году была построена первая церковь Святой Троицы. В 1903 году начали строить кирпичную церковь, высота колокольни которой составляла 93 метра.
Святая Благословенная Троица является собой единое Божество в трёх ипостасях, что означает «три в одном»: Отца, Сына и Святого Духа, что и отражено изображением голубя с нимбом в солнечном кольце с пламенеющими лучами и держащего терновый венец, где солнечное кольцо символизирует Бога-Отца, голубь с нимбом символ Бога-Святой Духа, а терновый венец символизирует Бога-Сына, Иисуса Христа, нашего Господа и Спасителя.
Лазоревый (синий, голубой) цвет символизирует безупречность, добродетель, волю, чистое небо, богатые водоёмами земли поселения.
Чёрно-серебряные полосы, в виде фонтана, аллегорически указывают на нефть и артезианские воды, которыми богаты недра поселения.
Серебро (белый цвет) также символизирует чистоту, ясность, миролюбие и спокойствие.
Чёрный цвет является символом постоянства, мудрости, достоинства.
Автор герба, изображение и обоснование символики: В. Нагаевский (Тихорецк).

Материалы предоставлены М.Шаруновым и В. Марковым