Флаг Томского района утвержден Решением Думы Томского района № 58 от 24 марта 2020 года. Согласно тексту Положения о флаге района:

"Флаг Томского района представляет собой прямоугольное полотнище белого цвета с отношением ширины флага к его длине – 2:3. В центре полотнища помещается изображение герба муниципального образования «Томский район» (приложение к Положению о флаге Томского района).
Обратная сторона флага зеркально повторяет его лицевую сторону".

Текст документа прислан В. Пермяковым.

На фотографиях - флаги района в кабинетах чиновников Томского района.