Сельский населенный пункт Шея входит в Сунтарский улус Якутии. Поселение основано в 1905 году.

Флаг муниципального образования сельское поселение "Шеинский наслег" утвержден решением наслежного Совета депутатов № 5 от 25.04.2025 года. Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 15513. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Шеинского наслега в зеленом, синем, желтом и белом цветах".

Материалы геральдического архива В. Маркова