Шарьинский район образован в 1929 году в составе Нижегородской (Горьковской) области. В 2004 году район наделён статусом муниципального района - Шарьинский муниципальный район, в его составе созданы муниципалитеты первого уровня. Областным законом от 21 марта 2025 года Шарьинский муниципальный район был преобразован в Шарьинский муниципальный округ. При этом все муниципалитеты первого уровня в границах района упразднены. Центр района, а затем округа - город Шарья - не входит в состав округа, является отдельным МО - городским округом.

Флаг Шарьинского района утвержден 30 сентября 2003 года и внесен в Государственный геральдический регистр под № 1322. Описание флага:

"Флаг Шарьинского района представляет собой прямоугольное полотнище, с соотношением ширины к длине 2:3, разделенное по горизонтали белой чешуйчато изогнутой полосой в 1/30 ширины полотнища на две неравные части: синюю в 7/9 ширины полотнища, воспроизводящую в центре плывущую вправо на белой волне белую фигуру ладьи из герба района, и красную в 1/6 ширины полотнища".

Использована иллюстрация и текст на странице ООО "Ареал-Сервис"

В 2025 году Шарьинский муниципальный район преобразован в муниципальный округ. Символы Шарьинского муниципального округа утверждены Решением Думы Шарьинского МО от 29 апреля 2026 года № 154 "Об официальных символах муниципального образования Шарьинский муниципальный округ Костромской области", ими стали уже существующие символы Шарьинского муниципального округа (утв. 2003 г.). Описание герба согласно Положению о флаге:

"Флаг муниципального округа представляет собой прямоугольное полотнище, с соотношением ширины к длине 2:3, разделенное по горизонтали белой чешуйчато изогнутой полосой в 1/30 ширины полотнища на две неравные части: синюю в 7/9 ширины полотнища, воспроизводящую в центре плывущую вправо на белой волне белую фигуру ладьи из герба округа, и красную в 1/6 ширины полотнища".

Материалы геральдического архива В. Маркова