Флаг и герб Понтонного разработаны авторским коллективом: Башкиров Константин Сергеевич, Карпунина Виктория Валерьевна и Штейнбах Светлана Юрьевна. Флаг утвержден Решением Муниципального совета МО поселок Понтонный №68/157-1 от 17 мая 2007 года. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 3370.

"Флаг МО "посёлок Понтонный" представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к длине- 2:3, воспроизводящее композицию герба МО поселок Понтонный в красном, синем и желтом цветах".

Символика флага повторяет символику герба, поэтому приведем здесь и обоснование символики герба Понтонного:
"Символика герба отражает название поселка Понтонный. Золотой якорь с перекрещенными поверх него двумя такими же топорами - эмблема на погонах понтонных батальонов инженерных войск русской армии в 1909-1917 гг. Поселок берет свое начало с 1712 г., когда на окраине сельца Вознесенское (позднее - Корчмино), отданного в кормление ближайшему сподвижнику Петра I генерал-майору Корчмину В. Д. была расквартирована первая в России понтонная рота в количестве 36 человек, на вооружении которых находились жестяные понтоны голландского типа. Однако современный облик поселок начал приобретать в 1906 г., когда была пущена железная дорога Санкт-Петербург-Череповец, построены жилые дома, а в новые казармы возвратился с Русско-Японской войны понтонный батальон. Лагерь понтонеров располагался вдоль нынешней улицы Лагерное шоссе, там, где ныне находится стадион "Парус" и до улицы Победы п. Саперный до Корчминского ручья. Самый старый дом, сохранившийся в поселке построен именно в 1906 г. (дом N 8 по ул. А. Товпеко). Золотые ромбы (листы фанеры) символизируют Усть - Ижорский фанерный комбинат (бывшая фабрика, принадлежавшая инженеру-технологу Владимиру Леонидовичу Хорвату), основанный в 1910 г. Их (т. е. ромбы) можно рассматривать как символическое изображение понтонов. Якорь- это и символ Усть - Ижорской судоверфи, заложенной Морским ведомством России на земле, которая была выкуплена в 1912 г. у крестьян села Вознесенское (ныне - Средне - Невский судостроительный завод). Лазоревый столб- символ реки Невы. Золото- могущество, сила, постоянство, вера, справедливость, добродетель, верность. Лазоревый (синий, голубой) - слава, честь, верность, искренность, безупречность. Червлень (красный)- символ боевой и трудовой славы, честь, энергию и огонь промышленного производства и. т. д. Сила, могущество, благородство, право, мужество храбрость, неустрашимость. Геральдический цвет Санкт-Петербурга. Кроме того, на карте 1903 г. "План Колпино и его окрестностей" хранящейся в Архиве г.Колпино обозначены многочисленные кирпичные заводы, расположенные на месте современного МО. Из произведенного здесь кирпича построено большое количество зданий Санкт-Петербурга.

По материалам "Независимого информационного портала посёлка Понтонный" (спасибо В.Маркову)