Флаг сельского поселения утвержден Решением Собрания депутатов Поляковского сельского поселения от 22 декабря 2010 года № 119 "О флаге муниципального образования Поляковское сельское поселение" [по данным В. Маркова № 118]. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 6691. Согласно тексту Положения о флаге:

"3. Описание и обоснование символики флага Поляковское сельского поселения
3.1. Описание флага Поляковского сельского поселения:
Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Поляковского сельского поселения в красном, синем и белом цветах.
3.2. Обоснование символики флага Поляковского сельского поселения:
Красное поле и якоря обозначают красногвардейский морской десант.
Терновый венец – принесенные жертвы, разгром десанта и гибель красногвардейцев.
Синяя оконечность с осетром означает Азовское море, на берегу которого находится поселок, рыбные богатства и промыслы в этих местах.
3.3. Авторская группа:
идея флага: Олег Тесля (Таганрог).
компьютерный дизайн: Олег Дмитриев (Таганрог),
обоснование символики: Олег Тесля (Таганрог)".

По сообщению Б.Вольфова, рисунок герба взят из "Википедии"