Флаг Панинского СП утвержден Решением Совета депутатов муниципального образования - Панинское сельское поселение от 24 мая 2019 года № 15/8. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 12473. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, имеющее вдоль древка вертикальную жёлтую полосу шириной 1/4 длины флага, в верхней части которой помещено изображение старинной зеленой княжеской шапки с черной опушкой, над которой - желтое украшение («городок») с красным самоцветом. Основная часть полотнища состоит вверху из горизонтальной красной полосы шириной в 1/3 флага, а внизу из зеленой и синей равновеликих частей, вертикально разграниченных волнистой линией, в центре которых помещено изображение белого голубя, летящего к древку с воздетыми крыльями".

По информации В. Маркова. Текст документа прислан В. Пермяковым