Флаг и герб муниципального образования сельское поселение "Новотроицкое" утверждены Решением Совета сельского поселения "Новотроицкое" муниципального района "Читинский район" Забайкальского края от 4 ноября 2023 года № 67. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 14658. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище синего цвета с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры герба сельского поселения «Новотроицкое», выполненные в белом, зеленом, желтом и телесном цветах".

Березовые листья символизируют праздник Святую Троицу. Золотой слиток - история возникновения села Ильинка связана с золотодобычей.

Материалы геральдического архива В. Маркова