Флаг Новобирюсинского МО утвержден Решением Думы Новобирюсинского муниципального образования от 29 августа 2018 г. № 39. Согласно тексту Положения о флаге:

Флаг муниципального образования представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию из герба муниципального образования с заменой геральдических серебра, золота и лазури соответственно белым, жёлтым и голубым цветом.

Столб с волнами обозначает реку Бирюсу; пояс с каймой - железную дорогу; ель - тайгу; лось - типичный представитель местной фауны.

По сообщению В. Маркова. Текст документа прислан В. Пермяковым

В том же году Решением Думы Новобирюсинского муниципального образования от 31 октября 2018 г. № 46 утверждено новое Положение о гербе и флаге муниципального образования, а решение от 29.08.2018 г. признано утратившим силу. В отличие от августовского в октябрьском решении содержатся ссылки на федеральные и региональные законы о символах, сами муниципальные символы не изменились.

Текст документа прислан В. Пермяковым

По рекомендации Геральдического совета при президенте РФ флаг был несколько подкорректирован.

Решением Думы Новобирюсинского МО от 26 июня 2019 года № 70 взамен Положения о гербе и флаге от 31.10.2018 г утверждено Новое положение о гербе и флаге Новобирюсинского муниципального образования. Новая редакция описания флага:

"Флаг муниципального образования представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию из герба муниципального образования с заменой геральдических серебра, золота и лазури соответственно белым, жёлтым и голубым цветом. Оборотная сторона флага является зеркальным отображением его лицевой стороны".

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 12586.

Текст документа прислан В. Пермяковым