Нелидовский район существовал в Калининской области с 1935 года.

Флаг Нелидовского района разработан В.И.Лавреновым на основе герба района. Флаг утверждён Решением Собрания депутатов района № 87 от 6 мая 1999 года.

Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3 с изображением на полотнище композиции гербового щита.

Композиция флага напоминает о ведущих отраслях промышленности Нелидовского района - деревообработке и угледобыче.

Флаг района внесён в Государственный геральдический регистр под № 488.

Материалы взяты с сайта "Регионального геральдического центра"

В 2018 году муниципальный район упразднён, и образовано новое муниципальное образование "Нелидовский городской округ". При этом все городские и сельские поселения в составе Нелидовского района утратили муниципальный статус. В административно-территориальном отношении Нелидовский район также упразднен, вместо него создан "округ".

Cразу же, Решением Нелидовской городской Думы от 24 декабря 2018 года № 67-1 было установлено, что герб и флаг упраздненного муниципального образования "Нелидовский район" будут по-прежнему использоваться в работе органов власти Нелидовского городского округа.

Флаг Нелидовского городского округа утвержден Решением Нелидовской городской Думы от 24 декабря 2020 года № 217-1. Фактически символами городского округа стали бывшие символы Нелидовского района Тверской области (ут.в 1999 г.)

"2.1. Геральдическое описание герба:
В зеленом щите на узком пониженном серебряном поясе таковая же ель, а в черной оконечности жита две перекрещенных серебряных кирки (Приложения 1, 2 к настоящему положению).
2.2. Описание флага: Прямоугольное зеленое полотнище с отношением ширины к длине 2:3 с изображением на полотнище композиции гербового щита (Приложение 3 к настоящему положению).
2.3. Герб и флаг утверждены решением Собрания депутатов Нелидовского района Тверской области от 06.05.1999 № 87.

По информации В. Пермякова

В октябре 2024 года законом Тверской области муниципальное образование "Нелидовский городской округ" было преобразовано в Нелидовский муниципальный округ.

Герб и флаг Нелидовского муниципального округа утвержденыРешением Думы Нелидовского муниципального округа от 13 февраля 2025 года № 87-2 "Об утверждении Положения о гербе и флаге Нелидовского муниципального округа Тверской области". В решении было сказано:

"Считать флаг Нелидовского района, утвержденный решением Собрания депутатов Нелидовского района Тверской области от 06.05.1999 № 87, зарегистрированный в Геральдическом Совете при Президенте Российской Федерации, внесенный в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под регистрационным номером 488 – флагом Нелидовского муниципального округа Тверской области".

Описание флага не изменилось:

"2.2. Описание флага: Прямоугольное зеленое полотнище с отношением ширины к длине 2:3 с изображением на полотнище композиции гербового щита.
Фигуры флага аллегорически показывают географические и социально-экономические особенности округа.
Ель в зелёном поле — символ лесной зоны и деревообрабатывающей промышленности.
Две серебряные кирки символизируют традицию строительства шахт, освоение и добычу каменного угля.

По информации В. Маркова