Навлинский район образован в 1929 году в составе Западной области, с 1944 года - в Брянской области. В 1963-65 гг район временно упразднялся. Центр - рабочий поселок (поселок городского типа) Навля.

Флаг Навлинского района. Видимо, неофициальный. Данные 2015 года.

Рисунок воспроизведен по статье Д.В.Кузнецова и А.В.Шпунтова "Двадцать семь ошибок Брянской геральдики" [журнал "Самиздат"].

Символы Навлинского муниципального района утверждены Решением Навлинского районного совета народных депутатов от 27 февраля 2026 года № 7-139 "Об утверждении Положения об официальных символах (гербе и флаге) Навлинского муниципального района Брянской области". Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 15485.

9.1. Описание флага Навлинского района:
"Прямоугольное белое полотнище с соотношением сторон 2:3, на котором воспроизводятся фигуры из герба Навлинского района, выполненные в зеленом, красном, белом и желтом цветах".
Оборотная сторона флага является зеркальным отображением его лицевой стороны.
9.2. Флаг составлен на основе герба муниципального образования и повторяет его символику.

Для справки: "Обоснование символики герба Навлинского района:
Герб Навлинского района отражает исторические, культурные, природные и экономические особенности района, трудовые достижения и боевые подвиги жителей.
Зеленая ель – символизирует богатые навлинские леса, щедрую русскую природу, а также принадлежность Навлинского района к Брянской области.
Красные и зеленые ленты – это символ партизанского движения в годы Великой Отечественной войны, мужества и героизма жителей района.
Шестерня – знак промышленного развития района, это универсальная эмблема машиностроения, авторемонтных и механических отраслей народного хозяйства.
Золотые колосья – это трудолюбие жителей села, плодородие полей, обильный урожай, а также большое значение сельского хозяйства для экономики района.

По информации И. Афонасенко