Флаг Наяхитского наслега утвержден Решением наслежного Совета депутатов № 25 от 26 февраля 2020 года.

Лира символизирует традиции охрового пения. Якутский орнамент "рыбацкая сеть" обозначает озеро Балыктах.

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр под № 13740.

Материалы геральдического архива В.Маркова (г.Санкт-Петербург)