Могинский район образован в 1929 году, административный центр - город Можга. В 1963-65 гг. существовал укрупненный "Можгинский сельский район". В 2006 году муниципальное образование в границах района наделено статусом "муниципального района". До 2021 года существовало муниципальное образование "Можгинский район" (муниципальный район). В 2021 году муниципальный район преобразован в муниципальный округ (но в названии округа слово "район" сохранено; район также сохранился и как административно-территориальная единица).
Флаг Можгинского района.
Использованы материалы сайта Удмуртской республики 2006 г. [даже в декабре 2013 г. этот флаг изображался на сайте района]
Решением Совета депутатов МО "Можгинский район" от 27 ноября 2013 года №19.6 принят новый флаг района: "ФЛАГ представляет собой прямоугольное полотнище червленного (красного) цвета, с размещением посередине композиции герба Можгинского района. Соотношение ширины Флага к его длине – 2:3".
Использованы материалы сайта Можгинского района
Окончательно флаг утверждён Решением Совета депутатов муниципального образования "Можгинский район" № 21.13 от 5 марта 2014 года "О внесении изменений в Положение «О флаге муниципального образования "Можгинский район". Описание: "Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба в красном, белом и желтом цветах".
Использованы материалы геральдического архива В. Маркова
Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 9417 в июне 2014 года.
Еще в 2021 году на официальном сайте МО "Можгинский район" публиковался проект Решения "О переходе официальных символов муниципального образования "Можгинский район" муниципальному образованию "Муниципальный округ Можгинский район Удмуртской Республики". Согласно этому решению муниципальный округ должен был унаследовать символы муниципального района. Однако, приняли ли депутаты это решение, пока не известно.