Флаг Лобни утвержден Решением Совета депутатов города Лобни от 12 июля 2001 года №85/11 со следующим описанием:

"Статья 8
Флаг города Лобня представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, с двухсторонним изображением.
Основная часть (4/5) - красная как традиционно сложившийся цвет героизма российского народа.
Другая часть флага (1/5) - синяя (светлый ультрамарин) символизирует о бескрайних просторах воздушного и водного пространства России.
В верхней части флага - парящая чайка белого цвета как символ уникального озера Киово.
Внизу на красном фоне белая стилизованная волнистая линия.

Материалы справочной правовой системы "Гарант". Рисунок (реконструкция) выполнен для "Вексиллографии" Ф. Шмидтом

Положение о флаге и рисунок флага Лобни утверждены Решением Совета депутатов МО "город Лобня" от 9 октября 2003 года №41/482. Согласно Положению о флаге муниципального образования "город Лобня" Московской области:

"...
1.1. Флаг муниципального образования "город Лобня" Московской области (далее - флаг города Лобня) составлен на основании герба города Лобня, по правилам и традициям геральдики, и отражает исторические, культурные, социально-экономические, национальные и иные местные традиции.
...
3. Описание и обоснование символики флаги города Лобня
3.1. Описание флага города Лобня: "Флаг города Лобня представляет собой прямоугольное полотнище в соотношением ширины к длине 2:3, разделенное по вертикали на две неравные полосы: вдоль древка - синюю в 1/4 длины полотнища и красную в 3/4 длины полотнища, воспроизводящее белые фигуры из гербовой композиции: в крыже на пересечении полос - чайку, и вдоль нижнего края красной части полотнища - отвлеченную чешуйчато изогнутую нить".
3.2. Обоснование символики флага города Лобня.
Композиция флага города Лобня отражает исторические и социально-экономические особенности. Город вырос из поселка, возникшего в 1902 году при железнодорожной станции. Разделение полотнища на синюю и красную части аллегорически показывает железную дорогу, делящую город на две части. Вместе с тем, разделение полотнища и красная его часть говорят о героическом прошлом города Лобня: в годы Великой отечественной войны 1941-45 гг. по территории современного города главный рубеж обороны Москвы шел вдоль железнодорожной магистрали. Красный цвет символизирует труд, жизнеутверждающую силу, мужество, праздник, красоту. Синяя часть полотнища аллегорически показывает мирную жизнь, и, вместе с тем, бескрайние просторы воздушного океана. Синий цвет соответствует небу, воздуху и символизирует красоту, истину, честь и добродетели. Чешуйчато изогнутая нить и парящая чайка аллегорически символизируют уникальный памятник природы города - озеро Киово. Серебро - символ совершенства, благородства, чистоты, веры, мира. Золото - символ высшей ценности, величия, прочности, силы, великодушия.
3.3. Авторская группа:
идея флага: Владимир Коробков (г.Лобня), обоснование символики: Галина Туник (г.Москва), компьютерный дизайн: Сергей Исаев (г.Москва), Юрий Коржик (г.Воронеж)".

Использованы материалы официальной страницы администрации города Лобня

Новая редакция Положение о флаге Лобни утверждена Решением Совета депутатов города Лобня от 24 августа 2017 года № 353/18. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 11606. Величины голубой и красной полос стали одинаковыми.

2.1. Описание флага городского округа Лобня:
«Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух равновеликих вертикальных полос: голубого (у древка) и красного цветов, в центре которого – летящая наискось вниз к древку чайка с распростёртыми в стороны крыльями, ниже которой – нитевидная чешуевидная не доходящая до краев полотнища полоса белого цвета.»
2.2. Обоснование символики флага городского округаЛобня:
Композиция флага городского округа Лобня отражает исторические и социально-экономических особенности. Город вырос из посёлка, возникшего в 1902 году при железнодорожной станции. Рассечение щита на лазурь и червлень аллегорически показывает железную дорогу, делящую город на две части.
Вместе с тем, рассечение щита и красная его часть говорят о героическом прошлом городского округа Лобня: в Великую Отечественную войну в ноябре-декабре1941года по территории современного городского округа проходил рубеж обороны Москвы.
Красный цвет символизирует труд, жизнеутверждающую силу, мужество, праздник, красоту.
Синяя часть щита аллегорически показывает мирную жизнь, и, вместе с тем, бескрайние просторы воздушного океана.
Синий цвет соответствует небу, воздуху и символизирует красоту, истину, честь и добродетели.
Парящая чайка и чешуйчато изогнутая нить аллегорически символизируют уникальный памятник природы городского округа - озеро Киово.
Белый цвет - символ совершенства, благородства, чистоты, веры, мира.
Желтый цвет - символ высшей ценности, величия, прочности, силы, великодушия.
2.3. Авторская группа:
- идея флага: Иван Нагорный (Лобня); Владимир Коробков (Лобня), Константин Мочёнов (Химки);
- обоснование символики: Галина Туник (Москва);
- компьютерный дизайн: Юрий Коржик (Воронеж).

По сообщению В. Пермякова