Деревня Кубня входила в состав Малокармалинского сельского поселения Ибресинского района. С 2022 года непосредственно входит в Ибресинский муниципальный округ.

Флаг населенного пункта деревня Кубня утвержден Решением Схода граждан населенного пункта деревня Кубня Ибресинского муниципального округа от 05.11.2025 г. Протокол (без №) и установлен официальным символом населенного пункта деревня Кубня Решением Собрания депутатов Ибресинского муниципального округа от 27.11.2025 г № 36/13. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 15448.

Геральдическое описание флага населенного пункта деревня Кубня:
"Прямоугольное зеленое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию фигур из герба населенного пункта деревня Кубня, выполненную зеленым, белым, желтым и синим цветами. Обратная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую".

Обоснование символики флага населенного пункта деревня Кубня.
Флаг населенного пункта деревня Кубня создан на основе герба населенного пункта деревня Кубня и повторяет его символику.

По информации К. Мочёнова