Герб и флаг муниципального образования "город Кронштадт" утверждены Решением муниципального совета №38 от 24 августа 2006 года. Тогда же утверждено Положение о гербе МО город Кронштадт и Положение о флаге МО город Кронштадт. Согласно тексту Положения о флаге:

"Флаг муниципального образования города Кронштадта представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к длине - 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования города Кронштадта в голубом, белом, красном, зеленом, черном и желтом цветах".

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 2450.

Решением Муниципального Совета г.Кронштадта от 8 сентября 2011 года №41 в решение от 24.08.2006 г об утверждении официальных символов Кронштадта внесены технические поправки.

[На городском сайте в 2009 году было приведено изображение флага в виде белого полотнища с гербовым щитом...

По материалам сайта города Кронштадта

По сообщению А.Куприна ("БИАР", г.Москва) изготавливались и варианты флагов Кронштадта с якорями в углах.

Решением Муниципального Совета г. Кронштадта от 27 марта 2014 года №15 в решение от 24.08.2006 г. внесены очередные изменения. Описание флага изложено по-новому:

"Флаг муниципального образования город Кронштадт представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к длине – 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования город Кронштадт (без элементов: корона и знак города воинской славы) в голубом, белом, красном, зеленом, черном и желтом цветах".

По сообщению В.Пермякова.