Флаг Котласского района утвержден решением Собрания депутатов муниципального образования "Котласский муниципальный район" № 462 от 15 ноября 2019 года.

"Прямоугольное полотнище зеленого цвета с размещенными на нем тремя синими (голубыми) полосами, сходящимися в центре. Две полосы имеют диагональную направленность от нижних углов к центру флага, третья - вертикальная, выходящая из центра флага и оканчивающаяся на верхнем крае флага. Отношение ширины флага к его длине 2:3. Отношение ширины полос к длине флага 1:10. В центре флага размещается герб МО «Котласский муниципальный район».

По информации В. Маркова

В 2022 году Котласский муниципальный район преобразован в Котласский муниципальный округ (все сельские поселения в его составе утратили муниципальный статус). При этом район как административно-территориальная единица сохранен.

Флаг Котласского муниципального округа утвержден решением Собрания депутатов Котласского муниципального округа Архангельской области № 176 от 1 декабря 2023 года и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 14854. Флаг повторяет композицию герба округа.

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к его длине 2:3, воспроизводящее фигуры из герба Котласского муниципального округа, выполненные красным, зеленым, белым, желтым цветами".

По информации В. Маркова