Флаг поселка Комарово утверждён Решением муниципального Совета муниципального образования "поселок Комарово" № 14-1 от 30 сентября 2014 года.

"3. Описание ФЛАГА
Флаг муниципального образования поселок Комарово представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к длине- 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования поселок Комарово в синем и желтом цветах".

Символика флага понятна из обоснования герба:

" "...2. В гербе муниципального образования поселок Комарово условный геральдический щит разделен линиями, образующими две литеры «К», что указывает на историческое и современное названия поселка. Посередине помещена часть ветви сосны как символ северной природы. Расцветка герба указывает на море и на золотистый песок побережья, на солнечный свет и чистое небо. В то же время цвета сохраняют свое традиционное символическое значение: золото – изобилие, лазурь – духовность.

По сообщению В. Пермякова

Флаг поселка внесён в Государственный геральдичекий регистр РФ под № 9813.