Колпашевский район образован в 1924 году. В 1953-1965 гг район временно упразднялся. В 2004 году МО "Колпашевский район" наделено статусом муниципального района. В его составе созданы Колпашевское городское поселение и несколько сельских поселений. С 2024 года официальное наименование - Колпашевский муниципальный район.

Судя по фотографиям флагов у команд района на спортивных соревнованиях, флаг района белый с изображеним герба.

Фото - https://tomsk.gov.ru/; https://sport.tomsk.gov.ru/news/front/view?id=151908 [2025]