Киржач (село или слобода) возник в XIV веке, с 1778 года - центр Киржачского уезда Владимирского наместничества (губернии). Киржачский район образован в 1929 году в составе Ивановской промышленной области, потом некоторое время входил в Московскую область, с 1944 года - во Владимирской области. В конце 1990-х годов в границах района образовано одноимённое муниципальное образование. После реформ начала 2000-х годов МО именовалось "Киржачский муниципальный район". В его составе выделялись городское поселение город Киржач и 4 сельских поселения: Горкинское, Кипревское, Першинское, Филипповское. Областным законом от 25 апреля 2025 года Киржачский муниципальный район преобразован в Киржачский муниципальный округ, все муниципалитеты в составе района (в т.ч. городское поселение город Киржач) упразднены.

Флаг Киржачского района утверждён Решением Киржачского районного Совета народных депутатов от 29 апреля 1998 года № 6/54 "О внесении изменений в Устав Киржачского района".

"Флаг Киржачского района представляет собой прямоугольное полотнище красного цвета с отношением ширины к длине 2:3, с изображением в центре флага герба Киржачского района. Габаритная ширина герба на флаге составляет 2/5 части длины полотнища флага".

Источник - "Википедия", рисунок подготовлен В. Пермяковым

Новый флаг Киржачского района утвержден решением Совета народных депутатов Киржачского района от 26 сентября 2008 года №44/671 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №4433. Описание флага:

"Прямоугольное зеленое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль верхнего края красную полосу в 1/4 ширины полотнища и воспроизводящее фигуры районного герба: сову сидящую на пне, выполненные белым, серым, черным и желтым цветами".

Обоснование символики флага Киржачского района.
Флаг Киржачского района разработан на основе герба, который создан с учетом исторического герба города Киржач Владимирского наместничества, Высочайше утвержденного 16 августа 1781 года. Подлинное описание исторического герба гласит:
"Въ верхней части гербъ Владимiрскiй. Въ нижней - въ зеленомъ поле, сидящая на пне, съ распростертыми крыльями, птица сова, каковыхъ въ окрестности сего города находится весьма довольно".
Использование на районном флаге композиции перекликающейся с гербом города Киржач и имеющей в своей основе исторический герб XVIII столетия подчеркивает историческую и территориальную общность двух муниципальных образований и символизирует бережное отношение местных жителей к своей истории и традициям.
На флаге района почетная фигура - полоса красного цвета аллегорически символизирует лучшие качества местных жителей, преемственность поколений, единство прошлого, настоящего и будущего.
Сова - традиционный символ мудрости, бдительности.
Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, солнечного тепла, уважения.
Зеленый цвет - символ природы, здоровья, молодости, жизненного роста.
Черный цвет - символ скромности, разума, вечности бытия.
Авторская группа:
идея флага: Константин Моченов (Химки), Владимир Березин (Александров);
художник: Роберт Маланичев (Москва);
компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (Конаково).

По материалам сайта "Союза геральдистов России"

До 2025 года в составе Киржачского муниципального района выделялось городское поселение город Киржач.

Флаг городского поселения Киржач утвержден Решением Совета народных депутатов городского поселения город Киржач Владимирской области от 27 февраля 2009 г. №15/221 "О флаге муниципального образования городское поселение г. Киржач" . Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 4803. Согласно тексту Положения о флаге:

"3. Описание и обоснование символики флага городского поселения город Киржач
3.1. Описание флага городского поселения город Киржач:
"Прямоугольное зеленое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль нижнего края желтую полосу в 2/9 ширины полотнища и воспроизводящее фигуры герба городского поселения: желтую ушастую сову сидящую на черном пне".
3.2. Обоснование символики флага городского поселения город Киржач.
Флаг городского поселения городского поселения город Киржач создан с учетом герба, который разработан на основе исторического герба города Киржач Владимирского наместничества, Высочайше утвержденного 16 августа 1781 года. Подлинное описание исторического герба гласит:
"Въ верхней части гербъ Владимiрскiй. Въ нижней - въ зеленомъ полъ, сидящая на пнъ, съ распростертыми крыльями, птица сова, каковыхъ въ окрестности сего города находится весьма довольно".
Использование на современном флаге композиции исторического герба города показывает внимание местных жителей к своему прошлому, бережное отношение к истории и традициям своего города.
Сова - традиционный символ мудрости, бдительности.
Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, солнечного тепла, уважения.
Зеленый цвет - символ природы, здоровья, молодости, жизненного роста. Черный цвет - символ скромности, разума, вечности бытия.
Нумерация приводится в соответствии с источником
3.5. Авторская группа:
- идея флага: Анна Корнеева (Киржач), Константин Моченов (Химки), Владимир Березин (Александров);
- художник и компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва);
- обоснование символики: Кирилл Переходенко (Конаково).

По материалам справочной правовой системы "Гарант" и сайта Союза геральдистов России

После преобразования района в Киржачский муниципальный округ символы переутверждены Решением Совета народных депутатов Киржачского муниципального округа от 30 сентября 2025 г. N 1/6 "Об официальных символах муниципального образования Киржачский муниципальный округ Владимирской области". Было установлено:

1. Использовать в качестве официальных символов муниципального образования Киржачский муниципальный округ Владимирской области:
...
2) флаг муниципального образования городское поселение город Киржач Киржачского района Владимирской области, утвержденный решением Совета народных депутатов городского поселения город Киржач от 27.02.2009 N 15/221 (Свидетельство о регистрации официального символа или отличительного знака в Государственном геральдическом регистре Российской Федерации 4803, утверждено протоколом N 48 от 25 апреля 2009 года).

3.1. Описание флага Киржачского муниципального округа:
"Прямоугольное зеленое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль нижнего края желтую полосу в 2/9 ширины полотнища и воспроизводящее фигуры герба Киржачского муниципального округа: желтую ушастую сову, сидящую на черном пне".

Материалы геральдического архива В. Маркова