Флаг Кестеньгского СП утверждён решением Совета МО "Кестеньгское сельское поселение" № 144 от 27 июня 2013 года. Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 8749.

Прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба в синем, зеленом, белом и желтом цветах.

Обоснование символики
Олень - символ стремительности, грации, красоты, благородства, смелости и силы.
Кантеле (карело-финские гусли) символизирует творчество, духовную жизнь.
Лазоревый (синий, голубой) символизирует истину, чистое небо, славу, честь, верность, искренность, безупречность.
Зеленый - символ радости, жизни, возрождения природы каждую весну.

Материалы геральдического архива В. Маркова