Город Кедровый построен специально для нефтяников, работающих на Пудинской группе нефтегазовых месторождений, в 1987 году Кедровый стал городом областного подчинения. Село Пудино возникло в 1915 году. В 1939-1959 годах село Пудино было центром Пудинского района. До 2006 года Кедровый входил в состав "Муниципального образования Пудинское". С 2006 года - муниципальное образование "город Кедровый".

12 апреля 2007 года Дума города Кедрового Решением №23 утвердила Положение об официальных символах муниципального образования "Город Кедровый", рисунки герба и флага города. Символами МО "город Кедровый" стали бывшие символы МО "Пудинское". Согласно тексту Положения:

"2. Флаг муниципального образования представляет собой прямоугольное полотнище бело-зеленого цвета с соотношением ширины флага к его длине 2:3. Полотнище разделено на два поля: белое и зеленое, что соответствует полям в гербе. В центре полотнища помещается изображение герба муниципального образования без геральдического щита размером 1:3 от его площади".

Использованы материалы сайта города Кедрового (лето 2007)

Решением Думы города Кедрового от 19 ноября 2009 года №63 в решение от 12.4.2007 г. об официальных символах МО внесены изменения: утверждены новые рисунки герба и флаг и их новые описания.

"Статья 2. Описание официальных символов муниципального образования «Город Кедровый»
1. Описание герба муниципального образования: «В серебряном поле выгнутый вправо лазоревый язык пламени и выгнутая влево чёрная капля (друг подле друга), сопровождаемые во главе положенной влево червлёной кедровой ветвью с зелёными иглами и червлёными шишками.
1.1. Обоснование символики герба муниципального образования.
Герб отражает исторические, экономические, природные особенности муниципального образования. Серебряное поле символизирует экологию, чистоту, стремление сохранить окружающую природу. Ветка кедра с шишками указывает на название города Кедрового. Кедр – символ силы, неподкупности, достоинства, долговечности. Лазоревый язык пламени природного газа и черная капля нефти символизируют природные богатства.
В гербе языком символов и аллегорий гармонично отражены история становления города Кедрового, его природные особенности и основной профиль деятельности местного населения".
2. Флаг муниципального образования представляет собой прямоугольное полотнище белого с отношением ширины к длине 2:3, в центре которого выгнутый к древку язык пламени голубого цвета и, возле него, выгнутая от древка капля черного цвета, выше которых – направленная от древка кедровая ветвь красного цвета с шишками красного цвета и иглами зеленого цвета.».

Использованы материалы сайта Администрации МО Кедровый (2014)

Флаг Кедрового внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №5785.

Вариант флага у спортивной команды Кедрового. Фото сделано в ходе XXXV областных зимних сельских спортивных игр Томской области в 2019 году.