Чёрно-Курьинский район Сибирского края образован в 1925 году. В 1929 году райцентр перенесён в посёлок при станции Карасук, в 1933 район переименован в Карасукский. С 1944 года - район в Новосибирской области. В 2004 году Карасукский район получил статус муниципального района. В составе Карасукского муниципального района до 2024 года существовало МО "городское поселение город Карасук". В 2024 году областным законом Карасукский муниципальный район преобразован в Карасукский муниципальный округ.

Флаг района разработан А. В. Кошелевым и А. Ю. Журавковым и утверждён Решением Совета депутатов Карасукского района от 24 февраля 2005 года "Об утверждении флага Карасукского района". Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 1858.

"Флаг Карасукского района представляет собой прямоугольное полотнище жёлтого цвета несущее в середине изображение чёрного бегущего коня с красными глазами и языком. В верхней половине флага располагается опрокинутый зелёный треугольник с изображением выходящего снизу жёлтого цветка подсолнуха, имеющего чёрную сердцевину.
Внизу полотнища проходит синяя трижды выщербленная полоса, занимающая 1/5 ширины флага.
Отношение ширины флага к его длине 2:3".

Источник - "ВИКИПЕДИЯ" (редактор страницы В. Пермяков)

После преобразования района в Карасукский муниципальный округ (2024) сначала было принято Решением Совета депутатов Карасукского муниципального округа от 21 октября 2024 года № 18 "О применении герба и флага Карасукского района Новосибирской области в качестве официальных символов Карасукского муниципального округа Новосибирской области" , а затем в него внесены изменения Решением Совета депутатов Карасукского муниципального округа от 17 июля 2025 года № 256. Изменения заключались в уточнении формулировке п.1: "Применять герб и флаг Карасукского района Новосибирской области в качестве официальных символов Карасукского муниципального округа Новосибирской области".

Использованы материалы официального сайта Карасукского МО