Флаг и герб муниципального района "Койгородский" Республики Коми утверждены решением Совета муниципального района «Койгородский» от 25.09.2024 г. № VI-35/305 Описание флага муниципального образования муниципальный район "Койгородский":

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из синей и зеленой равновеликих горизонтальных полос, на котором воспроизведена композиция фигур из герба муниципального образования в белом, желтом, черном и красном цветах".
Оборотная сторона флага является зеркальным отображением его лицевой стороны.
Флаг составлен на основе герба муниципального района «Койгородский» и повторяет его символику.

Обоснование символики герба:
Герб муниципального района «Койгородский» выполнен в основных цветах государственных символов Республики Коми, что обозначает принадлежность района к национальной республике и культуре коми.
Синий цвет – это небесное начало, олицетворение великодушия и возвышенных устремлений, а также богатых водных ресурсов района. Белый цвет воплощает чистоту снега и суровую красоту северной природы. Зеленый цвет обозначает необъятные таежные массивы коми Пармы.
Золотой «Шондiбан» – национальный символ – олицетворяет Солнце и небесные силы, которым поклонялись древние коми, это символ надежды и возрождения.
Глухарь символизирует уникальный национальный парк «Койгородский» – самый крупный сохранившийся к настоящему времени массив не затронутых антропогенным воздействием девственных таежных лесов в Европе. Здесь сохраняется естественное биоразнообразие, а также встречается более 100 редких видов растений и животных, занесенных в Красные книги Российской Федерации и Республики Коми. Глухарь – одна из самых крупных и благородных птиц местных лесов, а в геральдике глухарь это символ мудрости, достатка, процветания и благополучия.

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 15070.

По информации И. Афонасенко.