Кадыйский район образован в 1935 году в составе Ивановской Промышленной области, с 1944 года входит в Костромскую область. В 2004 году создано одноименное муниципальное образование - муниципальный район. В июне 2024 года областным законом Кадыйский муниципальный район преобразован в Кадыйский муниципальный округ.

Первый вариант флага Кадыйского района утверждён Решением Собрания депутатов Кадыйского муниципального района № 28 от 31 марта 2006 года.

""Прямоугольное полотнище соотношением ширины к длине 2:3. состоящее из вертикальных полос: двух синего - по краям, каждая шириной 1/5 длины полотнища и одна белого цветов, с внутренней стороны к синим полосам примыкает по одной зеленой вертикальной полосе каждая шириной 1/15 от длины полотнища. В центре белой полосы главная геральдическая фигура Кадыйского района: два пука (снопа) срезанной травы осоки зеленого цвета, близко расположенных друг от друга, высота изображения пука (снопа) осоки составляет 1/2 от высоты полотнища, ширина 1/3 от длины полотнища".

Окончательная версия флага Кадыйского района утверждена Решением Собрания депутатов Кадыйского МР № 73 от 31 октября 2006 года. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище белого цвета с соотношением ширины к длине 2:3, несущее у древка лазоревую полосу в 1/4 длины полотнища, производящее в центре главную геральдическую фигуру Кадыйского района: два пука (снопа) срезанной травы осоки зеленого цвета, близко расположенных друг от друга. Высота изображения пука (снопа) составляет 1/2 от ширины полотнища, ширина - 1/3 от длины полотнища".

Использована иллюстрация и текст на странице ООО "Ареал-Сервис"

Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 2890.