Флаг сельского поселения утверждён Решением Гончаровского сельского совета от 15 сентября 2011 года № 27/1 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 7070.

Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Гончаровского сельского поселения в красном и желтом цветах.

По сообщению В. Пермякова. Данные о внесении в ГГР предоставлены В. Марковым.