Черниговский район образован в 1926 году. В 2004-2023 годах существовало муниципальное образование Черниговский муниципальный район. Областным законом от 27 января 2023 года создан Черниговский муниципальный округ.
Флаг Черниговского муниципального округа утвержден решением Думы Черниговского муниципального округа от 28 января 2026 года № 207-НПА. Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 15472.
Описание флага Черниговского муниципального округа:
"Прямоугольное полотнище белого цвета с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры из герба Черниговского муниципального округа, выполненные красным, синим, желтым и белым цветами. Обратная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую».
Обоснование символики флага Черниговского муниципального округа.
Флаг Черниговского муниципального округа создан на основе герба Черниговского муниципального округа и повторяет его символику.
Червленый (красный) цвет олицетворяет храбрость, мужество, неустрашимость жителей Черниговского муниципального округа, любовь к родине и готовность пролить за нее кровь.
Золотой пшеничный колос символизирует исторически основной промысел Черниговского муниципального округа – хлебопашество.
Золото (желтый цвет) – символ высшей ценности, богатства, милосердия, постоянства, прочности, силы, интеллекта и солнечного света.
Лазоревая (синяя) оконечность символизирует водные ресурсы Черниговского муниципального округа и его расположение на берегах озера Ханка и основных рек: Дмитриевка, Илистая, Медведица, Монастырка, Скотская, Черниговка.
Водная гладь, во многом занимает юго-восточную часть Приханкайской равнины, на которой расцветает лотос – цвет душевной чистоты и целомудрия. Цветок лотоса - символ долголетия и воскресения, его белый (серебряный) цвет – благородство, правдивость, надежда. Золотая семенная коробочка – знак плодородия.
Авторская группа:
идея флага: Дума Черниговского муниципального округа;
геральдическая доработка: Константин Моченов (Химки);
компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва).
По информации К. Моченова