В 1925 году создан Чановский район в составе Сибирского края. С 1937 года - в Новосибирской области. Райцентр - пгт. Чаны. В 2004 году Чановский район получил статус муниципального района. В 2025 году областным законом Чановский муниципальный район преобразован в Чановский муниципальный округ.

Флаг Чановского района утвержден решением Совета депутатов Чановского района Новосибирской области первого созыва от 12 апреля 2005 года "Об утверждении флага Чановского района". Флаг внесен в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под № 1856. Описание флага Чановского района:

"Флаг Чановского района представляет собой прямоугольное полотнище синего цвета несущее в середине изображение двух белых лебедей с желтыми клювами, плывущих друг к другу. Внизу полотнища проходят три горизонтальных полосы белого, синего и желтого цветов, занимающих 1/14, 1/42, и 1/8 ширины флага соответственно. У древка полотнища проходит зеленая полоса, занимающая 1/6 длины флага и несущая стилизованные изображения трех желтых караваев с солонками. Отношение ширины флага к его длине 2:3".

Флаг воспроизводит композицию герба. Авторы флага: Журавков А.Ю. (он же художник), Кошелев А.В.

Использованы материалы сайта Сибирской геральдической коллегии