Флаг Братковского с.п. утверждён решением Совета МО "Братковское сельское поселение" №116 от 3 мая 2007 года и внесён в Государственный геральдический регистр под № 3377. Описание флага:

"Прямоугольное синее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Братковского сельского поселения, зеленым и белым цветами".
Обоснование символики флага Братковского сельского поселения.
Флаг разработан на основе герба Братковского сельского поселения, в котором языком символов и аллегорий отражены природные и экономические особенности сельского поселения.
Братковское сельское поселение объединяет село Братковское и хутор Журавский.
Сельское поселение богато источниками чистой воды (белые ключи), что аллегорически показано фонтаном с двумя белыми струями.
Опрокинутая белая пирамида многократно пересечённая синими горизонтальными полосами аллегорически указывает на красивые и чистые водоёмы поселения.
Синий цвет - символизирует честь, благородство, духовность.
Зелёный цвет - символ сельского хозяйства, здоровья, природы, жизненного роста.
Белый - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Авторская группа:
Идея флага и художник: Н. Ищенко (ст. Дядьковская);
Геральдическая доработка: М. Шарунов (Краснодар);
Компьютерный дизайн: М. Шарунов (Краснодар);
Обоснование символики: М. Шарунов (Краснодар), В. Нагаевский (Тихорецк)".

Материлы предоставлены М.Шаруновым (г.Краснодар)