Большеулуйский район образован в 1924 году. С 2005 года муниципальное образование в границах района имело статус муниципального района. Согласно Закону Красноярского края от 15 мая 2025 года Большеулуйский район стал частью Ачинского муниципального округа, перестав быть отдельным муниципальным образованием.

Флаг Большеулуйского района утверждён Решением Совета депутатов Большеулуйского района от 24.12.2020 года № 05 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 13468.

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба в зеленом и белом цветах".

По информации В. Маркова