Рыбинский район образован в 1925 году в составе Тарского округа Сибирского края. В 1933 году село Рыбино было переименовано в Большие Уки, а Рыбинский район - в Большеуковский район. До 2025 года муниципальное образование именовалось "Большеуковский муниципальный район". Областным законом от 29 октября 2024 года муниципальный район преобразован в муниципальный округ "Большеуковский район". Административный центр — село Большие Уки.

Флаг Большеуковского района утвержден Решением Совета Большеуковского муниципального района № 315 от 30 марта 2020 года. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 13178. Описание флага согласно Положению о флаге:

"Прямоугольное полотнище, разделённое по горизонтали на зелёную и синюю полосы, в центре белый бегущий лось".

Авторская группа: идея флага – Казначеев Сергей Николаевич, геральдическая доработка и прорисовка– Журавлёв Е. Н. (член Сибирской геральдической коллегии).

По материалам сайта "ГЕРАЛЬДИКА.РУ". Текст документа прислан В. Пермяковым.