Название села в переводе с тюркского звучит как "пять ручьев" или "пять родников". Муниципальное образование "село Бешпагин" упраздено в 2020 году при преобразовании Грачевского муниципального района в Грачевский муниципальный округ.

Герб и флаг муниципального образования села Бешпагир Грачевского района Ставропольского края утверждены решением Совета депутатов муниципального образования села Бешпагир Грачевского района Ставропольского края № 191 от 23 июля 2019 года. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 12564. Описание флага:

"Жёлтое полотенце с соотношением сторон 2/3 с голубой полосой в 1/4 ширины флага по диагонали справа, сопровождаемая по сторонам: вверху слева пурпурной сторожевой башней «в кладку» со стенозубчатым верхом о трёх зубцах, открытыми воротами и тремя бойницами, внизу справа – зелёной сосновой шишкой".

5 перевязей обозначают название села (в переводе "пять ручьев"). Шишка – сосновая роща, башня – Бешпагирский редут.

По информации В. Маркова. Текст документа прислан В. Пермяковым