Флаг района утвержден решением Совета депутатов МО "Базарносызганский район" от 6 июля 2005 года №9 "Об официальных символах МО "Базарносызганский район". Согласно тексту Положения о гербе и флаге МО "Базарносызганский район":

"8.Флаг муниципального образования "Базарносызганский район" является официальным символом муниципального образования "Базарносызганский район".
Флаг муниципального образования "Базарносызганский район" представляет собой прямоугольное полотнище лазоревого цвета с соотношением длины флага к его ширине 3:2. В нижней 1/3 части флага две равновеликие полосы: верхняя --золотая, нижняя - зеленая".

По материалам сайта района - http://bsizgan.narod.ru/Sim.htm

Новый флаг района утвержден решением Совета депутатов муниципального образования "Базарносызганский район" от 15 ноября 2013 года №23 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 8884. Согласно тексту Положения о флаге:

"Описание флага
"Прямоугольное двухстороннее синее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры герба Базарносызганского района в зеленом и желтом цвете".
Обоснование символики флага Базарносызганского района.
Флаг Базарносызганского района составлен на основе герба Базарносызганского района и отражает языком символов и аллегорий исторические и природные особенности Базарносызганского района.
Название района и название административного центра района поселка Базарный Сызган - по реке Сызганка (от татарского топонима "сыза" - овраги и "ган" - русло - "овражное русло"). Скосы, переходящие в оконечности флага в вертикальную полосу - гласное подтверждение названия района и его административного центра
Сызганская слобода основана в 17 веке стрельцами на месте более древнего мордовского поселения как сторожевой пограничный пункт на подступах к Карсунской засечной черте, что в гербе символически показано крепостной башней с отходящим в стороны палисадом.
Крепость в гербе Базарносызганского района аллегорически отражает и тот факт истории Базарного Сызгана, когда годы Гражданской войны на подступах к станции Базарная части белочехов, двигающихся на Москву, были остановлены. Это стало началом разгрома белочешского мятежа.
Крепость - символ защиты, опоры, надежности, сплочения и единства.
Лазурь - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Зеленый цвет символизирует природу, сельскохозяйственные угодья, весну, здоровье, молодость и надежду.
Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, стабильности, богатства, урожая и солнечного света.
Авторская группа:
Идея флага: Сергей Гурьянов (р.п. Базарный Сызган), Константин Моченов (Химки);
художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва);
обоснование символики: Константин Моченов (Химки)".

Материалы сайта Союза геральдистов России