Флаг Балтасинского района утвержден решением Совета Балтасинского муниципального района № 56 от 21 декабря 2006 года. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №2884 и в Государственный геральдический реестр Республики Татарстан под №85. Согласно тексту Положения о флаге:

"3.1. Описание флага Балтасинского муниципального района:
"Флаг представляет собой прямоугольное голубое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры герба: вдоль нижнего края зеленую полосу в 3/10, над ней посередине полотнища – медведя с топором, а вплотную к древку – сруб в три бревна, воспроизведенные желтым, черным и белым цветом".
3.2. Обоснование символики флага Балтасинского муниципального района.
Флаг разработан на основе герба района, который языком символов и аллегорий отражает природные и культурные особенности района.
В основе топонима «Балтаси» (тат. «Балтач») присутствует легендарное имя одного из основателей села. Слово «балтач» производно от татарского «балта» - топор (балтачы, балта остасы – человек, владеющий топором; мастер-плотник).
Главной фигурой флага является медведь, держащий в лапах топор. Медведь - традиционный символ мощи, силы, уверенности, хозяин леса. Медведь не только аллегория рачительного хозяина, но и мастера (плотника), строителя. Медведь возводит дом, что подчеркивает широко известные традиции и искусность балтасинских мастеров по дереву.
Традиционный геральдический приём – «вооружение» – изображение когтей, зубов и языка одним цветом с самой фигурой медведя, подчёркивает мирные намерения жителей. Цвет топора – белый (серебро) – символизирует чистоту, совершенство, мир и взаимопонимание.
Природная тематика указывает на одно из главных богатств района – лес. Поэтому медведь, как хозяин леса, является и аллегорией защиты, бережного отношения населения района к своей природе.
Большое значение природных ресурсов в жизни района подчеркнуто цветовой гаммой флага: зелёный цвет – символ природы, здоровья, молодости и жизненных сил; голубой цвет – символ чести, благородства, духовности, олицетворяет природные памятники – реку Шошму и гордость района – озеро Кара-Куль; желтый (золото) – символ урожая, богатства, стабильности, интеллекта, уважения.
3.3. Авторская группа:
Разработка флага произведена Геральдическим советом при Президенте Республики Татарстан совместно с Союзом геральдистов России в составе:
Рамиль Хайрутдинов (Казань), Радик Салихов (Казань), Ильнур Миннуллин (Казань), Григорий Бушканец (Казань), Константин Мочёнов (Химки), Кирилл Переходенко (Конаково), Оксана Афанасьева (Москва).

По материалам сайта "Территориальная геральдика Республики Татарстан"