В 1991 года в составе Восточного административного округа создан муниципальный округ "Богородское". В 1995 году на его основе создан район Богородское. В 2003 году в муниципальной структуре Москвы создано муниципальное образование Богородское (в границах одноименного района). Ныне - муниципальный округ Богородское.

Флаг МО Богородское утверждён Решением муниципального Собрания № 6 от 13 апреля 2004 года.

"Флаг муниципального образования Богородское представляет собой двустороннее, прямоугольное полотнище с соотношением сторон 2:3. В голубом полотнище помещено прилегающее к его нижнему краю изображение белого, куполообразно-выгнутого стропила, габаритные размеры которого составляют 3/4 длины и 7/16 ширины полотнища. Над изображением стропила помещено изображение желтой геральдической розы, габаритные размеры которого составляют 3/10 длины и 7/16 ширины полотнища. Центр изображения равноудален от боковых краев полотнища и находится на расстоянии 5/16 ширины полотнища от его верхнего края".

Флаг муниципального образования повторяет его герб. Символика герба:

"Золотая роза, являясь геральдическим символом Девы Марии (Богородицы), символизирует древнее название поселения XIV-XV вв., располагавшегося на месте муниципального образования. По одной из версий, это название отождествлялось с сельцом Богородским, упомянутым в 1443 году в завещании княжны Елены Ольгердовны, вдовы князя Серпуховского и Боровского Владимира Андреевича Храброго. Серебряное стропило символизирует находящийся на территории муниципального образования памятник московской архитектуры - церковь Спаса Преображения".

Использованы материалы официального сервера правительства Москвы

Решением Совета депутатов МО Богородское от 9 декабря 2021 года № 14/02 существующие герб и флаг муниципального образования Богородское решено считать символами Богородского муниципального округа, тогда же утверждены новые Положения о гербе и флаге. Рисунок флага изменениям не подвергся (хотя его и немного "освежили"). Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 13827, а также в геральдический реестр города Москвы под номером МС № 13/2.

2.1. Описание флага муниципального округа Богородское:
"Прямоугольное синее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования с заменой геральдических цветов: серебра – белым, золота – желтым".

Источник - сайт МО Богородское