Флаг района Кантемир утвержден решением районного Совета № 07/08-XXVI от 8 декабря 2016 года и внесен в Общий гербовник РМ Указом президента РМ № 103-VIII от 28 марта 2017 года (опубл. "Monitorul Oficial al Republicii Moldova Nr. 109-118")
Флаг района представляет собой прямоугольное полотнище (2:3), разделенное горизонтально трехчастно желто-зелено-белым в пропорции 1:3:1 и обремененное в зеленом поле белым лебедем-шипуном с красным клювом, плывущим к древку по линии верхнего края белого пояса.