Флаг района Дондушень утверждён Решением районного совета Дондушень № 33/5 от 25 апреля 2014 года и подтверждён Указом президента Молдовы № 1565 от 7 мая 2015 года "О введении в обращение и регистрации герба и флага района Дондушень". Автор - А. Сильвиу-Табак.

"Флаг района Дондушень представляет собой прямоугольное белое полотнище (2:3) с красным косым крестом, обремененным двумя желтыми колосьями пшеницы, положенными в косой крест, и сопровождаемым в кантонах четырьмя зелеными опрокинутыми айвовыми листьями".

По сообщению Й. Паттке, текст Указа предоставлен К. Богатовым

Флаг опубликован в "Monitorul Oficial al Republicii Moldova" 2015. Anul XXII, 15 mai.