С середины 1990-х называлось "староство города Вейсеяй" (Veisiejų miesto seniūnija), но в 2014 году принято название "Вейсеяйское староство". Староство входит в состав Самоуправления Лаздийского района в Алитусском уезде. Центр - город Вейсеяй (Veisiejai).

Флаг староства повторяет по композиции герб города Вейсеяя, утвержденный 23 марта 2000 года. В верхней части полотнища белый крест на красном, в нижней части - на белом фоне три чёрных утки.

Серебряный крест на красном фоне является знаком Святого Георгия, патрона местной церкви. Утки символизируют богатство природы, а также косвенно "называют" озеро Анчя, на котором расположен город (по-литовски "утки" - "антис").

Использованы материалы В.Мисюнаса (Virginijus Misiunas) на сайте "Flags of the Worlds"