Название города до 1795 года - Сауле. В Российской империи город именовался Шавли и входил в Ковенскую губернию. Ныне город Шяуляй (Šiauliai) является центром Шяуляйского уезда Литвы, а также Самоуправления Шяуляйского района.

Флаг города "гербовый", он повторяет композицию герба, дарованного в 1791 году, перерисованного в новом стиле в 1968 году и переутверждённого в 2001 году.

Городская администрация использует также парадный "репрезентативный" вариант флага - белое полотнище с изображением полного герба города Шяуляя.

Оба варианта флага подтверждены в "Порядке использования герба Шяуляя", утверждённом Советом Шяуляйского городского самоуправления решением от 26 февраля 2009 года №Т-71.

Использованы материалы официального городского сайта Шяуляя