Город Аникщяй (Anykščiai) ныне является центром Аникщяйского староства, входящего в состав Самоуправления Аникщяйского района в Утенском уезде.

На флаге Аникщяя изображен герб, дарованный в 1792 году и переутвержденный 4 ноября 1992 года. Свободный край полотнища украшен S-образными полосами зеленого и синего цвета.

Использован рисунок В.Мисюнаса для сайта Flags of the World

Флаг используется и в качестве флага Самоуправления Аникщяйского района.

В марте 2021 года опубликован ПРОЕКТ единого документа о порядке использования символики Аникщяйского района и самоуправлений в его составе. Этот флаг описан и там.

По материалам геральдического архива В.Маркова (г.Санкт-Петербург)